プリンタドライバ設定の「出力 PDF ファイルの設定をPDF Driverのみで行う」にチェックを入れていない場合（通常の場合）、PDF Driverの設定でセキュリティ設定を行わないで下さい。その後のPDF編集ができなくなって変換処理が失敗します。
PDF Driver設定のオプション「出力PDFファイルに出力設定のPDF設定を適用しない。」にチェックマークを付けていない場合（通常の場合）、PDF Driverの印刷設定と変換設定のPDF設定で同じ項目の設定を行った場合、文書情報などはPDF Serverの設定が優先されます。また、一部の設定（ウォーターマークなど）は、双方の設定が有効となりますので、このオプションを有効にする場合には注意が必要です。特にフォントの埋め込み等の設定を行わない場合、使用する印刷設定は「Default」が良いと思われます。