GUI では、組版できるページ数に上限を設けてあります。その初期値が 3000ページです。メニューの [ページ]-[ページ数制限] で変更が可能です。詳しくはオンラインマニュアルの「グラフィカルユーザインターフェイス」の「表示ページ数指定ダイアログ」をご覧ください。